种质纯度鉴定系统

种质纯度鉴定系统

全基因组SNP标记 · Naive Bayes鉴定模型 · 准确率99%

待测样本：

🧬 24个SNP特异性位点

Chr01A/G

Chr02C/T

Chr03A/T

Chr04G/C

Chr05A/C

Chr06G/T

Chr07A/G

Chr08C/T

Chr01A/T

Chr02G/C

Chr03A/C

Chr04G/T

Chr05A/G

Chr06C/T

Chr07A/T

Chr08G/C

Chr01A/C

Chr02G/T

Chr03A/G

Chr04C/T

Chr05A/T

Chr06G/C

Chr07A/C

Chr08G/T

位点匹配 位点差异 待检测

📋 鉴定报告

🧬

点击「开始鉴定」进行SNP基因分型

技术核心

全基因组重测序：采用DNBSEQ-T7平台（单样本≥24 Gb），GATK HaplotypeCaller做变异检测，PLINK FST筛选文椰5号和文椰6号之间的分化位点，锁定24个SNP特异性位点——就这么几个位点，足以把两个长得极像的品种区分开。

AI鉴定模型：Naive Bayes朴素贝叶斯算法，310个样本经PCA质控后213个建模+77个盲测验证。

分型平台：MassARRAY质谱，无需荧光标记，成本可控，支持幼苗期早期检测。

技术流程

嫩叶采样 → 液氮速冻 → DNA提取 → DNBSEQ-T7测序 → BWA比对 → GATK变异检测 → FST筛选24个SNP位点 → MassARRAY质谱分型 → Naive Bayes模型判定品种

核心专利

已公开发明专利：一种椰子品系纯度的鉴定方法、引物、芯片及应用，涵盖完整技术链，24个SNP位点区分文椰5号/文椰6号，准确率99%。

应用价值

• 文椰系列品种真实性鉴定（幼苗期可检）
• 种质资源纯度批次检测
• 繁育材料质量控制与溯源
• 新品种保护与品种权维护